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Un estudio identifica «vulnerabilidades» en una de las proteínas que muta más en cáncer

Participan investigadores del CRG de Barcelona y usan IA

Representación de la proteína KRAS. | Wikipedia

| Barcelona |

Un equipo del Centro de Regulación Genómica (CRG) de Barcelona y el Instituto Wellcome Sanger de Cambridge (Reino Unido) han identificado en un estudio con uso de inteligencia artificial (IA) «vulnerabilidades» de la proteína Kras, uno de los genes que muta más frecuentemente en cáncer. El estudio, publicado en la revista 'Nature', ha identificado «de manera exhaustiva» los lugares de control alostérico, que representan dianas terapéuticas preciadas para el desarrollo de fármacos ya que constituyen vulnerabilidades secretas que pueden ser usadas para controlar los efectos de una de las causas más importante del cáncer. Kras es uno de los genes que más mutaciones sufre en cánceres de muchos tipos y se encuentra en uno de cada diez cánceres humanos, con una mayor prevalencia en tipos severos como los de páncreas o pulmón.

La proteína a la que da lugar se ha comparado con la Estrella de la Muerte del universo 'Star Wars' por su forma esférica y su «impentrabilidad», y se ha considerado inabordable desde su descubrimiento en 1982. La única estrategia eficaz para controlar Kras ha sido atacar su sistema de comunicación alostérico --señales moleculares que funcionan a través de un mecanismo de control remoto de llave y cerradura--, y para controlarlo se necesita un compuesto químico o fármaco que pueda abrir un lugar activo. El CRG ha recordado que tras cuatro décadas de investigación solo dos fármacos han sido aprobados para uso clínico, y estos funcionan al unirse a una cavidad adyacente al lugar activo, induciendo un cambio conformacional alostérico en la proteína que impide su activación. El científico del CRG André Faure ha asegurado que este estudio demuestra un nuevo enfoque para cartografiar lugares alostéricos sistemáticamente en proteínas enteras.

Cartografía

Los autores del estudio cartografiaron los lugares alostéricos usando una técnica una técnica llamada 'escaneo mutacional profundo', con la que crearon más de 26.000 variaciones de la proteína Kras, cambiando solo uno o dos aminoácidos cada vez. Los investigadores utilizaron programas de IA para analizar los datos, detectar alosterismo e identificar la ubicación de lugares terapéuticos conocidos o nuevos. La técnica ha mostrado que Kras tiene mucho más lugares alostéricos de lo que se esperaba, y las mutaciones inhiben interacciones esenciales para la función de la proteína, «sugiriendo que es posible inhibir ampliamente su actividad». El estudio proporciona el primer mapa completo de lugares alostéricos obtenidos para una proteína completa y muestra que, con las herramientas y técnicas adecuadas, se pueden descubrir «nuevas vulnerabilidades» para modular muchas proteínas con relevancia clínica y que históricamente se han considerado inabordables.

En Baleares, la AECC entrega cerca de 180.000 euros a dos científicas de la UIB para impulsar sus investigaciones

La Asociación Española Contra el Cáncer (AECC) en Baleares ha entregado algo más de 176.000 euros a dos investigadoras predoctorales de la Universitat de les Illes Balears (UIB) y del Instituto de Investigación Sanitaria de Baleares (IdISBa) para impulsar sus estudios. La asociación ha reconocido a las dos científicas este lunes con motivo de la entrega de sus Ayudas Predoctorales en Investigación 2023, según ha explicado la AECC en una nota de prensa. Las premiadas han sido las investigadoras de la UIB Laura Gálvez, (76.100 euros) y del IdISBa Serena Sadoun, (100.600 euros) para desarrollar sus estudios en un máximo de cuatro años.

El presidente de AECC en Baleares, José Reyes, ha señalado que «impulsar la investigación oncológica debe ser una prioridad para toda la sociedad, en el que se incluyen gobiernos, empresas e instituciones». En ese sentido, la asociación ha destacado que lidera la iniciativa 'Todos contra el cáncer' con el objetivo de «aumentar la supervivencia media de las personas con cáncer al 70 por ciento para el 2030 y llevar los resultados de investigación al paciente».

El proyecto de Laura Gálvez, estudiante predoctoral en el grupo de Neurofarmacología del Iunics en la UIB y el IdISBa, pretende estudiar en modelos animales cómo la quimioterapia puede afectar a la eficacia del tratamiento antidepresivo, debido a la alta prevalencia de depresión en pacientes con cáncer y con la finalidad de «mejorar el enfoque terapéutico en clínica». «Gracias a la financiación otorgada por AECC podré estudiar a nivel preclínico la interacción entre fármacos en el contexto del tratamiento combinado de la comorbilidad cáncer-depresión y se espera que estas investigaciones sirvan en un futuro para mejorar la aproximación terapéutica a la clínica», ha explicado Gálvez.

Por su parte, Serena Sadoun, investigadora predoctoral en el grupo de 'Lípidos en patología Humana' del IdISBa, busca comprender la relación entre la obesidad y el cáncer de colon mediante su proyecto, al proporcionar recomendaciones individualizadas con enfoque preventivo de este tipo de cáncer y otras enfermedades crónicas asociadas; y curativo, para beneficiar a más de tres millones de personas en 2030. «Esta ayuda brinda la oportunidad de llevar a cabo una investigación vital sobre las causas desconocidas del cáncer de colon, su prevención y diagnóstico, con el fin de mejorar la calidad de vida de los pacientes. El apoyo de la asociación hace posible esta misión, marca una diferencia en mi carrera, en mi vida y en la de los pacientes», ha manifestado.

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