Las albuferas, por la elevada presencia de insectos voladores de diferentes grupos 'desde pequeños mosquitos hasta mariposas nocturnas', son lugares idóneos de alimentación de los quirópteros o murciélagos.
En s'Albufera de Mallorca viven al menos diez especies: el murciélago ratonero gris 'Myotis escalerai', el murciélago ratonero patudo 'Myotis capaccinii, el murciélago común 'Pipistrellus pipistrellus', el murciélago de Cabrera 'Pipistrellus pygmaeus', el murciélago enano de bosque 'Pipistrellus nathusii', el murciélago de borde claro 'Pipistrellus kuhlii', el murciélago de montaña 'Hypsugo savii', el murciélago hortelano 'Eptesicus serotinus', el murciélago orejudo gris 'Plecotus austriacus' y el murciélago rabudo 'Tadarida teniotis'.
Para favorecer estas especies, que otorgan un valor añadido en el espacio protegido y ayudan a controlar las poblaciones de mosquitos, se han colocado cajas refugio en diferentes lugares del Parque desde el año 2007, según informa el Govern en un comunicado.
En estos momentos ya hay una cincuentena, que se reparten por los alrededores de los edificios, en el pinar de ses Puntes y en las aceras de algunos caminos.
Las cajas refugio posibilitan también mejorar la información que se tiene de una especie migratoria procedente del norte de Europa: el murciélago enano de bosque 'Pipistrellus nathusii', que se descubrió en el Parque precisamente durante el primer año del seguimiento, el año 2007.
Asimismo, favorecen la puesta en marcha de programas educativos para dar a conocer este importante grupo de mamíferos voladores, todavía tan desconocido para una buena parte de los visitantes.
Se han utilizado diferentes modelos de cajas 'hechas de madera o de un aglomerado de madera y cemento', lo cual posibilita que las acepten especies que tienen requerimientos ecológicos diferentes, tanto las que utilizan pequeños agujeros y grietas en árboles como las que utilizan edificios y otras estructuras similares.
Cabe tener en cuenta que la cantidad de refugios naturales se vio notablemente reducida en el pasado por la desaparición de muchos árboles de seis a diez metros, y las cajas refugio constituyen una alternativa muy interesante.